192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3270 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3270  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 225 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8331  normal  0.0947304 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4446  hypothetical protein  53.33 
 
 		 229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.25718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4960  TetR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 230 aa  229  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0493125  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3552  regulatory protein TetR  35 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4047  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  29.77 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0251  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3109  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  23.83 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  28.51 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  36.78 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 224 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  23.57 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4572  putative transcriptional regulator, TetR family  26.36 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  0.111989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 271 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 268 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  31.79 
 
 		 199 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  24.55 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 255 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 224 aa  52  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  25.21 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  36.19 
 
 		 190 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  26.07 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 343 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  40 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3105  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 260 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2590  hypothetical protein  30.95 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.000498969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 250 aa  48.9  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 203 aa  48.1  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 240 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 293 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 304 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  28.8 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0775  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00421215  hitchhiker  0.000834873 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  28.85 
 
 		 241 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1602  transcriptional regulator  27.12 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 272 aa  46.2  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  47.92 
 
 		 315 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  34.09 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1495  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.969103  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 192 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  27.16 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  27.16 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  36.36 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  27.16 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>