231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1952 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  100 
 
 		 241 aa  474  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  56.87 
 
 		 233 aa  245  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  42.52 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 271 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  36.24 
 
 		 246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  35.27 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 242 aa  121  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 343 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  29.29 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  28.51 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  30.04 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6425  putative transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857124 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  32.11 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 263 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 224 aa  62  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4047  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  39.78 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  23.72 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  29.59 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  35.87 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  36.05 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  39 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  25.11 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  35.42 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  28.44 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  46.27 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  25.35 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  36.45 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  28.63 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  43.04 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  30.93 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  25.36 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 229 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 315 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  25.69 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 210 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  27.34 
 
 		 343 aa  52.4  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 283 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3270  transcriptional regulator, TetR family  25.33 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8331  normal  0.0947304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 230 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 211 aa  52.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 209 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>