More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5638 on replicon NC_010180
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 238 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1602  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  26.72 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  26.72 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  26.72 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 245 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  25.11 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3985  hypothetical protein  36.36 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  30.61 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  26.64 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  23.56 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 211 aa  62  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  22.41 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  25.14 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  22.83 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  25.18 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  25.31 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11383  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.900966 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  20.94 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04290  transcriptional regulator  25.88 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0356089  normal  0.115644 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  23.13 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  24.52 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1770  TetR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1817  TetR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  32.63 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3340  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1751  TetR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  24.77 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  23.85 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  24.34 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  20.76 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2177  TetR family transcriptional regulator  20.42 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.191251  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  23.65 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  23.55 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  24.69 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>