More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6464 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 245 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 271 aa  267  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  50.42 
 
 		 246 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  46.75 
 
 		 253 aa  195  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 242 aa  166  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  35.27 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 229 aa  102  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 226 aa  98.2  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  31.36 
 
 		 343 aa  96.3  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  32.55 
 
 		 272 aa  95.1  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 223 aa  93.2  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 220 aa  93.2  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 250 aa  92  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 228 aa  92  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  34.8 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  27.76 
 
 		 260 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 304 aa  88.6  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  41.6 
 
 		 268 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  31.42 
 
 		 223 aa  81.6  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  28.51 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  38.52 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  32.48 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  31.54 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  28.51 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  30.04 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  30.8 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  28.51 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 222 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  32.55 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  36.3 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  27.31 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  39.09 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 230 aa  72  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 238 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  25.73 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  27.95 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  45.57 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  43.16 
 
 		 173 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  32.06 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  27.39 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  29.29 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 266 aa  65.1  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  29.82 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>