198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0039 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  403  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  72.64 
 
 		 233 aa  296  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  56.19 
 
 		 238 aa  201  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10310  transcriptional regulator, tetR family  47.22 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0251  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 202 aa  91.7  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1632  Tetracyclin repressor domain protein  33.33 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0188717 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 224 aa  72  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0832  Tetracyclin repressor domain protein  28.65 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 234 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  25.56 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  25.96 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 285 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 268 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  31.39 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  27.27 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  25.24 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  24.82 
 
 		 304 aa  54.7  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 250 aa  54.7  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  22.93 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  24.66 
 
 		 259 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6425  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 253 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 255 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  27.92 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 315 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 183 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 258 aa  52  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 267 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 228 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 259 aa  51.6  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 278 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 244 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 244 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 244 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  42.55 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 252 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  27.97 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 235 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  26.71 
 
 		 266 aa  49.3  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 221 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 223 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 221 aa  48.5  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 228 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 249 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  22.82 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 223 aa  48.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  37.31 
 
 		 230 aa  48.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  27.2 
 
 		 241 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  23.53 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 272 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>