More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_23630 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  425  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 211 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 216 aa  95.1  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 211 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 218 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 271 aa  86.3  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 200 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0832  Tetracyclin repressor domain protein  34.42 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  32 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1632  Tetracyclin repressor domain protein  33.77 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0188717 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 223 aa  72  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0251  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  39.64 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  36.03 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  30.07 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  30.07 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  30.07 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  32.1 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  34.01 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  25.11 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  38.36 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  25.11 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 173 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  25.66 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  24.76 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 281 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  25.97 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4047  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3985  hypothetical protein  27.43 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  30.08 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 263 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 267 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  28.24 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3552  regulatory protein TetR  36.26 
 
 		 235 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>