286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7234 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 249 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  51.87 
 
 		 250 aa  218  7.999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  49.34 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  44.87 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  46.92 
 
 		 231 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 257 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  37.39 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  34.63 
 
 		 272 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  38.21 
 
 		 218 aa  106  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  35.11 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  35.55 
 
 		 224 aa  99.4  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  34.11 
 
 		 230 aa  95.9  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 242 aa  95.1  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  33.05 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 229 aa  93.6  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 238 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 263 aa  92  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  32.27 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  31.8 
 
 		 221 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  30.38 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 271 aa  89.4  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  32.18 
 
 		 222 aa  88.6  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 272 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  37.32 
 
 		 223 aa  86.3  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  33.47 
 
 		 226 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  34.53 
 
 		 226 aa  86.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 239 aa  85.1  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  41.54 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19920  transcriptional regulator, tetR family  37.5 
 
 		 207 aa  81.6  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  32.27 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  32.55 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  31.85 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  31.76 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  35.67 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  27.2 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 293 aa  75.1  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  29.71 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  27.73 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  38.52 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  30.91 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 218 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 224 aa  72  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  28.85 
 
 		 190 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  32.27 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  31.42 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  42.11 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4572  putative transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  0.111989 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  27.48 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  34.35 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>