202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6498 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 246 aa  493  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  50.42 
 
 		 245 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 271 aa  209  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 253 aa  158  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  36.97 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 267 aa  99  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  27.6 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 272 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  32.64 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 224 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  29.39 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  31.92 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  26.48 
 
 		 223 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  29.54 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 229 aa  72  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  43.01 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  29.96 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  26.82 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 281 aa  68.6  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  27.48 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  25.78 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  25.11 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  27.35 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  26.64 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  28.15 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  25.23 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  34.33 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  26.61 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 231 aa  62  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  30.77 
 
 		 228 aa  62  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2177  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.191251  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19920  transcriptional regulator, tetR family  30.83 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314765  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  27.52 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1602  transcriptional regulator  25.87 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  32.81 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  29.53 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>