More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8986 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 220 aa  448  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4572  putative transcriptional regulator, TetR family  43.87 
 
 		 223 aa  154  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  0.111989 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 226 aa  95.1  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  32.71 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 235 aa  74.7  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2589  regulatory protein TetR  43.59 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  41.49 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 263 aa  62  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3270  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8331  normal  0.0947304 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3750  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0181  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0631  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0664  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.783759  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  50 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0585  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0559  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  30.38 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  36.3 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2719  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3552  regulatory protein TetR  27.4 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  35.16 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2719  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  27.8 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 278 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1527  transcriptional regulator, TetR family  42.39 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 285 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  31.15 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  27.78 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5480  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  33.94 
 
 		 315 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3070  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>