More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0408 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 212 aa  415  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  50.25 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  38.19 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 218 aa  84.7  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  40.14 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  37.41 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  35.82 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  36.59 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  34.57 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  44.79 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 234 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 285 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  42.35 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  29.05 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  29.05 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  29.05 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  37.75 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  44.57 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  38.71 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2177  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.191251  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  44.74 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  35.78 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 258 aa  62  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 239 aa  62  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 272 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  30.13 
 
 		 260 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  29.67 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3125  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328687  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1632  Tetracyclin repressor domain protein  31.54 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0188717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10310  transcriptional regulator, tetR family  34.42 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  28.5 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  39.6 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  36.88 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>