More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3927 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 218 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  51.35 
 
 		 211 aa  144  8.000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 246 aa  111  6e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 259 aa  105  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  40.09 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  43.54 
 
 		 190 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  37.16 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 234 aa  95.5  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 220 aa  94.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 230 aa  92.4  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 255 aa  92.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  91.7  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 232 aa  91.3  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  30.08 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 268 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 255 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 253 aa  89  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  38.19 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 250 aa  89  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 244 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  32.63 
 
 		 343 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 195 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 244 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 244 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 272 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 285 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 218 aa  85.5  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  36.91 
 
 		 239 aa  85.5  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 210 aa  85.1  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  42.55 
 
 		 199 aa  84.7  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  34.97 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 263 aa  81.6  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  37.22 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 272 aa  75.1  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  28.32 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  30.92 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1632  Tetracyclin repressor domain protein  31.21 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0188717 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  32.11 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10310  transcriptional regulator, tetR family  35.23 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  28.44 
 
 		 247 aa  72  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 266 aa  71.6  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>