More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1930 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  415  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  55.12 
 
 		 225 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  55.12 
 
 		 225 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  55.12 
 
 		 225 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 210 aa  185  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 211 aa  184  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  49.24 
 
 		 210 aa  177  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  49.24 
 
 		 210 aa  177  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  42.36 
 
 		 203 aa  151  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  41.97 
 
 		 200 aa  151  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  39.9 
 
 		 212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  38.66 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  32.38 
 
 		 213 aa  99  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 192 aa  89.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 190 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3070  transcriptional regulator, TetR family  36.24 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 240 aa  72  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  31.29 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  29.77 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  28.84 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  36.24 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  31.92 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  26.91 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  34.25 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  28.51 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 223 aa  62  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 244 aa  62  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 250 aa  61.6  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  28.51 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1770  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1817  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1751  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  28.84 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  29.88 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 332 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  32.93 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  27.73 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 343 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 272 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>