226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2976 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  100 
 
 		 199 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  42.93 
 
 		 192 aa  124  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 192 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 192 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 192 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3070  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 216 aa  111  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 190 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  38.97 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 190 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  38.26 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 268 aa  71.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  33.16 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  33.16 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  33.16 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  31.82 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19490  transcriptional regulator, tetR family  58.49 
 
 		 168 aa  62  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  31.3 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1770  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1817  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1751  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2719  transcriptional regulator, TetR family  26.76 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  31.84 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5480  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 258 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3985  hypothetical protein  35.25 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 245 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1602  transcriptional regulator  26.88 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 285 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 232 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 183 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 207 aa  51.6  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 263 aa  51.6  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2177  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.191251  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  28.57 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 244 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 244 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 249 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1074  transcriptional regulator, TetR family  23.85 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 244 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1322  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 173 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  25.47 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 200 aa  48.1  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0775  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 185 aa  48.1  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00421215  hitchhiker  0.000834873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 235 aa  48.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 218 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 250 aa  48.1  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 188 aa  48.1  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 		 249 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  42.68 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 253 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  29.57 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  23 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2589  regulatory protein TetR  38.54 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3353  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.5987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>