177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_19490 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_19490  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 168 aa  320  6e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  44.52 
 
 		 206 aa  94  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  47.11 
 
 		 192 aa  92.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3070  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 216 aa  84.7  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  37.5 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 210 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 210 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1551  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 225 aa  57  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209171  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  37.11 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  37.11 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  37.11 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 268 aa  54.3  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  50.88 
 
 		 227 aa  53.9  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 238 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 267 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 240 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 263 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  40 
 
 		 203 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 223 aa  52  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 213 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 239 aa  51.6  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 271 aa  51.2  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 218 aa  50.8  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 232 aa  50.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 211 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 212 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 263 aa  50.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 211 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 247 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 268 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  33.52 
 
 		 213 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 253 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 228 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 249 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 220 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 213 aa  48.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3705  regulatory protein TetR  26.83 
 
 		 201 aa  48.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 228 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 283 aa  48.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 193 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  39.68 
 
 		 226 aa  48.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 242 aa  47.8  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 285 aa  47.8  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 214 aa  47.8  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 304 aa  47.8  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 222 aa  47.4  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3985  hypothetical protein  40 
 
 		 228 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 250 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3125  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328687  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1602  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 205 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0349  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  44.83 
 
 		 241 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 223 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4679  regulatory protein TetR  48.15 
 
 		 213 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 255 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 231 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  35.05 
 
 		 217 aa  45.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 385 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 204 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  38.46 
 
 		 215 aa  45.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1727  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 197 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0492221  normal  0.584646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 245 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  29.41 
 
 		 189 aa  45.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 193 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 272 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 218 aa  45.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 237 aa  45.1  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 221 aa  44.7  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  35.53 
 
 		 191 aa  44.3  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  22.12 
 
 		 200 aa  44.7  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  27.88 
 
 		 272 aa  44.7  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 200 aa  44.7  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 248 aa  44.3  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>