More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4683 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 385 aa  755    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 408 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  36.2 
 
 		 396 aa  196  8.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  37.89 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 424 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  33.42 
 
 		 410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  32.83 
 
 		 400 aa  168  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 451 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  30.89 
 
 		 390 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 406 aa  123  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 393 aa  119  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 412 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 412 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  28.61 
 
 		 425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  33.2 
 
 		 470 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 363 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 195 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 204 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 215 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 193 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 225 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 197 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 196 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 220 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 219 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 210 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 190 aa  55.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 220 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 212 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 215 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 197 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 212 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 194 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 197 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 195 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 197 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 200 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  35.62 
 
 		 188 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  35.62 
 
 		 188 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 216 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 203 aa  53.9  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 210 aa  53.9  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 212 aa  54.3  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  39.06 
 
 		 237 aa  53.9  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  35.48 
 
 		 212 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 226 aa  53.9  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 224 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  30.38 
 
 		 220 aa  53.5  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 202 aa  53.9  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 195 aa  53.9  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 211 aa  53.5  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 206 aa  53.5  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 199 aa  53.5  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 224 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 224 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 237 aa  53.5  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 224 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  37.84 
 
 		 208 aa  53.5  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 186 aa  53.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 224 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 210 aa  53.1  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 203 aa  53.5  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 233 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 235 aa  53.1  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 206 aa  53.1  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 212 aa  52.8  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 215 aa  53.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>