101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1727 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1727  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0492221  normal  0.584646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4737  putative transcriptional regulator, TetR family  49.74 
 
 		 192 aa  181  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.959543  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6683  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4496  hypothetical protein  30.53 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621109  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5057  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3084  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.634756  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2784  putative transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495892 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1470  putative transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596057  normal  0.840694 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2069  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3831  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.484216  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4387  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2514  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2002  putative transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341745  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 260 aa  48.9  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3543  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 223 aa  48.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0364286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  44.26 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4935  transcriptional regulator BetI  29.73 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1300  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.480052 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5113  transcriptional regulator BetI  29.73 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0491395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  29 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19490  transcriptional regulator, tetR family  40 
 
 		 168 aa  45.4  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  31.25 
 
 		 197 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 196 aa  45.1  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4996  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 197 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 192 aa  44.7  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0440  regulatory protein BetI  31.25 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  41.38 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4734  transcriptional regulator BetI  31.25 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0448  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  25.13 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  22.22 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  28.68 
 
 		 280 aa  44.3  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  29 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 406 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 125 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 245 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  25.69 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  29.17 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  29.17 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  27.4 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  29.17 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  29.17 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  30.56 
 
 		 219 aa  42.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  26.36 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0481  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 223 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  30.86 
 
 		 206 aa  42.4  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  28.36 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5643  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240264  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2070  transcriptional regulator BetI  26 
 
 		 202 aa  42  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2431  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 198 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 208 aa  42  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 197 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 225 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 231 aa  42  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 204 aa  41.6  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 190 aa  41.6  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  31.11 
 
 		 194 aa  41.6  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  25.77 
 
 		 198 aa  41.6  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  42 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 194 aa  42  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3560  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 247 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 196 aa  41.6  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4968  transcriptional regulator, TetR family domain protein  34.92 
 
 		 197 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 200 aa  41.6  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 197 aa  41.2  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 204 aa  41.2  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 192 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 192 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>