103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2069 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2069  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
191 aa  379  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4621  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
210 aa  111  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2514  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
191 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.348132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2431  transcriptional regulator, TetR family  36.93 
 
 
198 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324366  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6683  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
207 aa  101  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1470  putative transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 
192 aa  98.2  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596057  normal  0.840694 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3831  transcriptional regulator, TetR family  35.84 
 
 
208 aa  92  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.484216  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5057  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
214 aa  89.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389199  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4496  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  81.3  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4737  putative transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.959543  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1300  transcriptional regulator, TetR family  34.54 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.480052 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  33.16 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2703  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00115407  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 
186 aa  63.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4387  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
192 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1727  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 
197 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0492221  normal  0.584646 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3084  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 
201 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.634756  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 
214 aa  54.3  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2784  putative transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 
199 aa  52  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6235  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.706195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3766  hypothetical protein  25.7 
 
 
200 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.108876  normal  0.0885521 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
232 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
204 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
197 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 
194 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
193 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
193 aa  45.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
193 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
193 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
225 aa  45.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
194 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 
210 aa  45.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 
210 aa  45.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 
193 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
203 aa  45.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 
221 aa  45.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 
201 aa  45.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 
193 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2002  putative transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 
232 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341745  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
242 aa  45.1  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 
220 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
199 aa  45.1  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 
193 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
198 aa  45.1  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 
196 aa  45.1  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 
200 aa  44.7  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 
225 aa  44.7  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  29.35 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  40.38 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
238 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  38.18 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  36 
 
 
200 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  29.09 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1817  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 
195 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 
220 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 
203 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
239 aa  43.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3546  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
203 aa  42.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
200 aa  43.1  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1058  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 
208 aa  43.1  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5796  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 
207 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0048122 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 
188 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  37.74 
 
 
218 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3451  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
217 aa  42.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  35.63 
 
 
211 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.97 
 
 
232 aa  42.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1067  TetR family transcriptional regulator  20.99 
 
 
202 aa  42.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 
141 aa  42.4  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  24.5 
 
 
200 aa  42.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3867  putative transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 
219 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000371985  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 
213 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 
183 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2036  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 
203 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49858  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 
223 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
187 aa  42  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
223 aa  42  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4635  regulatory protein, TetR  28.04 
 
 
226 aa  42  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
210 aa  42  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 
221 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
216 aa  42  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 
186 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0023  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
205 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  25.73 
 
 
203 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4904  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
225 aa  41.6  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 
175 aa  41.6  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
221 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
213 aa  41.6  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1768  regulatory protein, TetR  35.63 
 
 
226 aa  41.6  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6699  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 
207 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.678516  normal  0.427356 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  36.92 
 
 
214 aa  41.6  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
227 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
190 aa  41.2  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0925  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 
207 aa  41.2  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
200 aa  41.2  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>