More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0130 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  381  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  60.31 
 
 		 197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  37.64 
 
 		 203 aa  114  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 199 aa  101  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 198 aa  99  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 367 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 192 aa  95.5  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 206 aa  95.1  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 203 aa  92.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 215 aa  92.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 194 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 194 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 197 aa  91.3  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  35.57 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  44.54 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  38.94 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  34.02 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  31.55 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  30.41 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  43.8 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  32.83 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  30.9 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  28.73 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  30.93 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2212  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326547  normal  0.584634 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  37.61 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  27.65 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  36.8 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  34.38 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 308 aa  58.2  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  31.84 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  28.93 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  26.77 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  29.41 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2824  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  29.41 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.87 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  27.87 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  24.74 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  24.74 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>