More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2813 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  408  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  43.81 
 
 		 205 aa  145  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  39.64 
 
 		 199 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  46.2 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  40.93 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  41.97 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 196 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 367 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 206 aa  99  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  98.2  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  35.32 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4314  transcriptional regulator, TetR family  40.83 
 
 		 206 aa  96.7  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.668708  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  50.41 
 
 		 202 aa  95.9  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  43.18 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 198 aa  95.1  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  37.62 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 198 aa  92.8  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 196 aa  92  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  36.41 
 
 		 203 aa  92  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  42.17 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 197 aa  88.6  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  39.89 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 194 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 177 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 192 aa  85.1  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  34.18 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  36.59 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  37.57 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 197 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  29.71 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  35.46 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  35.58 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  37.35 
 
 		 194 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  37.19 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  38.94 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1898  transcriptional regulator BetI  32.35 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4308  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0100295  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  30.93 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  31.28 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  31.07 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  31.07 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  31.07 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  50.79 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1071  regulatory protein, TetR  33.98 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0689162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  30.06 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0961  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0186381 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4012  transcriptional regulator BetI  30.97 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  30.51 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  20.69 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  30.51 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  30.06 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  30.51 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  30.51 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  30.51 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  30.51 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  30.51 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  30.06 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  28.32 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  27.93 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1948  transcriptional regulator BetI  24.23 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200723  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  27.37 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  29.48 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2070  transcriptional regulator BetI  25.13 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  29.48 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 245 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>