More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3573 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  400  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  73.98 
 
 		 198 aa  296  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  47.42 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  40.57 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  33.85 
 
 		 203 aa  97.8  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  36.16 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 196 aa  94.7  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 199 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 215 aa  91.7  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  31.84 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  33.76 
 
 		 203 aa  84.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 192 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 199 aa  84.3  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  40.8 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  39.66 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  37.06 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 367 aa  78.6  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  38.4 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4314  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.668708  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  52.05 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 199 aa  72  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  39.32 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  42.67 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 177 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  32.26 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  29.55 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  29.55 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  29.55 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  25.88 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  30.08 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  31.71 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  24.65 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  31.71 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  26.32 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 254 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  30.33 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  22.91 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  31.2 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  25.44 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 125 aa  52.4  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  29.91 
 
 		 215 aa  51.6  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  24.37 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  24.5 
 
 		 287 aa  51.6  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 236 aa  51.6  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  40 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0961  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 202 aa  51.2  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0186381 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  40 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  40 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1948  transcriptional regulator BetI  25.6 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  40 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  40 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  40 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  40 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>