More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0541 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  383  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4308  transcriptional regulator, TetR family  46.91 
 
 		 195 aa  147  8e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0100295  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  43.37 
 
 		 207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  39.22 
 
 		 203 aa  111  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 202 aa  97.8  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 199 aa  97.8  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  35.08 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 367 aa  82  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  34.3 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  40.5 
 
 		 209 aa  72  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  39.32 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  32.18 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 215 aa  67.8  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  37.82 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  37.72 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  41.03 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  24.23 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  45.07 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  37.5 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2940  TetR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4314  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.668708  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30040  hypothetical protein  30.51 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000857921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  39.84 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  43.42 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  30.64 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2069  regulatory protein, TetR  34.27 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.168032  normal  0.867534 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 241 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 224 aa  52  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 204 aa  51.6  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0961  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 202 aa  51.6  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0186381 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  40 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3575  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 200 aa  51.2  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 203 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 203 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 203 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 234 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  32.43 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 244 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1071  regulatory protein, TetR  39.36 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0689162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  32.43 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  39.29 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 211 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  31.4 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  31.4 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  31.4 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3158  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2010  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.267977  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  32.91 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>