More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5404 on replicon NC_011880
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  72.25 
 
 		 194 aa  283  8e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  71.73 
 
 		 194 aa  283  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5427  TetR family transcriptional regulator  70.33 
 
 		 97 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 197 aa  104  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 202 aa  89  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 203 aa  88.2  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 197 aa  85.9  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  31.18 
 
 		 199 aa  85.5  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 197 aa  85.1  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 196 aa  84.7  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  26.46 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  29.08 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  28.04 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1671  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.290262  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  28.27 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  24.35 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1071  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0689162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0961  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0186381 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  26.16 
 
 		 287 aa  58.2  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  26.46 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  26.46 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  26.84 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  24.87 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  25.4 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0440  regulatory protein BetI  28.06 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  25.4 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  25.4 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  26.35 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  25.65 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  32.99 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2824  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 226 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  25.93 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4734  transcriptional regulator BetI  27.55 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  25.93 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  25.93 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  25.93 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  25.93 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  25.93 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  24.08 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  26.51 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  26.04 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  25.93 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2915  transcriptional regulator BetI  24.57 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  24.16 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  25.4 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  24.61 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 287 aa  52.4  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  42.86 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  24.34 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 196 aa  51.6  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  23.31 
 
 		 308 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  27.07 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  27.07 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  24.21 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>