More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07900 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  357  6e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  80.43 
 
 		 193 aa  286  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  73.89 
 
 		 186 aa  252  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  57.06 
 
 		 189 aa  186  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  47.51 
 
 		 186 aa  147  8e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  45.2 
 
 		 184 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  42.54 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4528  transcriptional regulator, TetR family  43.92 
 
 		 172 aa  95.5  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 166 aa  93.2  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.25 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  31.25 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 181 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  32.35 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07310  hypothetical protein  37.89 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608576  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  32.7 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 221 aa  57  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 207 aa  57  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 414 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  29.93 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 238 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 241 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  29.89 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  47.17 
 
 		 237 aa  52.4  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2892  regulatory protein, TetR  42.25 
 
 		 635 aa  52.4  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794047  normal  0.565465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2312  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.48058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2824  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 226 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 240 aa  51.6  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2182  transcriptional regulator BetI  27.44 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  51.6  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0854  transcriptional regulator BetI  27.44 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 208 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  34.17 
 
 		 237 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  50.91 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 202 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 208 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  45.28 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  32.88 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  39.47 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  34.15 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>