More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1763 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  432  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  55.21 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  36.53 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 429 aa  72.8  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  29.19 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  39.83 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  30.38 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  33.87 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  30.22 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07310  hypothetical protein  50 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608576  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  40.87 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.5 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  32.5 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3625  putative transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.679664  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  39.82 
 
 		 190 aa  62  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  46.58 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  52.38 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  46.05 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38050  hypothetical protein  31.82 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  35.19 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 185 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 263 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1574  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 435 aa  53.9  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 180 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  38.06 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 166 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 230 aa  52.4  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 223 aa  52  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  48.28 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 200 aa  52  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 220 aa  52  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 255 aa  51.6  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 367 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 188 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 415 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  36.29 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 295 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2098  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0785695  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  36.5 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>