99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4528 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4528  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 172 aa  333  5e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  53.64 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  43.92 
 
 		 186 aa  99.4  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 184 aa  98.2  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  38.67 
 
 		 186 aa  91.7  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 188 aa  88.6  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  44.55 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  39.66 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 178 aa  62  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 178 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 178 aa  62  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 178 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  26.45 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.45 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  43.68 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  37.01 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  45.21 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 237 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 415 aa  55.8  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  41.43 
 
 		 241 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 206 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  31.66 
 
 		 225 aa  51.2  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 221 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 204 aa  48.5  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 429 aa  47.8  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 208 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 208 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2098  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 199 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0785695  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 204 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  27.67 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 221 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  22.56 
 
 		 192 aa  45.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 209 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  52.17 
 
 		 205 aa  45.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 203 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 195 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  53.33 
 
 		 207 aa  45.4  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 195 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 202 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 225 aa  45.1  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 195 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 206 aa  44.7  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  31.63 
 
 		 190 aa  44.7  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 201 aa  44.7  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 242 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1981  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 217 aa  42.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.992174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 218 aa  42.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 225 aa  42.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 245 aa  42  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  24.53 
 
 		 199 aa  41.6  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 206 aa  41.2  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 202 aa  41.2  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 248 aa  41.2  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 196 aa  41.2  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 184 aa  41.2  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 209 aa  40.8  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>