162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10790 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  400  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  71.29 
 
 		 202 aa  269  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  70.5 
 
 		 199 aa  266  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  68.34 
 
 		 203 aa  252  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  68.34 
 
 		 203 aa  252  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  68.34 
 
 		 203 aa  251  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  50.81 
 
 		 196 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  45.96 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3625  putative transcriptional regulator, TetR family  47.73 
 
 		 203 aa  125  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.679664  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38050  hypothetical protein  52.69 
 
 		 214 aa  118  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  32.99 
 
 		 186 aa  71.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07310  hypothetical protein  55.36 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608576  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  29.63 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  56 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  56 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  54 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  54 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.81 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  26.81 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  26.81 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  29.93 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  48.15 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0140  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 238 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 415 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 166 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2006  regulatory protein TetR  50.98 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1141  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  hitchhiker  0.000033846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 428 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  38.53 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 429 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  40.98 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  40.98 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 187 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.93 
 
 		 232 aa  48.1  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  30.99 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  43.64 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  56.1 
 
 		 207 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 187 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 242 aa  45.1  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00763  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.72 
 
 		 223 aa  44.7  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.827218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2846  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 223 aa  44.7  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0850  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.72 
 
 		 223 aa  44.7  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0861  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.72 
 
 		 223 aa  44.7  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2847  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.72 
 
 		 223 aa  44.7  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0304787 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0819  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.72 
 
 		 223 aa  45.1  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.852921 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00780  hypothetical protein  33.72 
 
 		 223 aa  44.7  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.978873  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0944  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.72 
 
 		 223 aa  44.7  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>