163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2006 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2006  regulatory protein TetR  100 
 
 		 196 aa  386  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0140  transcriptional regulator, TetR family  45.89 
 
 		 192 aa  116  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 202 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  58.62 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  35.76 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  57.38 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07310  hypothetical protein  55.17 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608576  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 240 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  54.41 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  31.91 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  49.25 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  50 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22570  hypothetical protein  30 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487793  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  52.73 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  52.73 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 415 aa  54.7  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  50.94 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 225 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 237 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  40.91 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 429 aa  52.4  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 234 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 428 aa  52  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  39.08 
 
 		 237 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 197 aa  51.2  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 187 aa  51.2  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2968  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  41.57 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3073  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.542296  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 225 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  45.31 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 236 aa  48.5  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  39.53 
 
 		 258 aa  48.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  40 
 
 		 243 aa  48.1  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  32.1 
 
 		 193 aa  48.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 218 aa  48.1  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 190 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 414 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  43.28 
 
 		 264 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  39.74 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 229 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3208  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.443054  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>