More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1709 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 195 aa  373  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 199 aa  195  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16550  transcriptional regulator, TetR family  58.52 
 
 		 207 aa  194  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.882037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4323  regulatory protein, TetR  57.65 
 
 		 201 aa  177  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0245964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  55.85 
 
 		 204 aa  177  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4763  TetR family transcriptional regulator  58.76 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781145  decreased coverage  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  50.52 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  46.24 
 
 		 204 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  44.33 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  45.6 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  42.93 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  47.88 
 
 		 194 aa  118  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 214 aa  112  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  39.09 
 
 		 209 aa  104  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 234 aa  87  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  36.42 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4004  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  57.58 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12926  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.394038 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  37.01 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1382  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6235  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 230 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.706195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2892  regulatory protein, TetR  36.59 
 
 		 635 aa  51.6  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794047  normal  0.565465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 218 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 210 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 210 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2310  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.145827  normal  0.0377448 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2470  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 217 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 217 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 219 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 244 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 332 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  44.64 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 252 aa  48.9  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 217 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 232 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 217 aa  48.5  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 221 aa  48.5  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 222 aa  48.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  31.3 
 
 		 197 aa  48.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 291 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 225 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 141 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  29.5 
 
 		 211 aa  47.8  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 194 aa  47.8  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0925  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 207 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 429 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  25.18 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>