226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5654 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  460  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  460  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  95.74 
 
 		 235 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  38.82 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4323  regulatory protein, TetR  37.69 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0245964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 221 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  36.03 
 
 		 194 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4763  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781145  decreased coverage  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  33.16 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  38.4 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 207 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4004  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4797  TetR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00913075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  45.59 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  46.38 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  24.5 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  22.96 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16550  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.882037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 215 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 215 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 215 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 218 aa  48.9  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 227 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 186 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 185 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 196 aa  46.6  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  32.91 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 209 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6862  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000147849  normal  0.19991 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 193 aa  46.2  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  21.83 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 214 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 206 aa  45.8  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 197 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 206 aa  45.8  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 200 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  47.46 
 
 		 201 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 183 aa  45.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 208 aa  45.4  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 259 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 259 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 197 aa  45.4  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 191 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 259 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 295 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>