More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2786 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 190 aa  389  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 186 aa  95.1  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 357 aa  92.4  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 227 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4428  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89429  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2025  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  35.05 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  31.88 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.19 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2686  regulatory protein TetR  44.12 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2716  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0607966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2923  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.30016e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2924  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  37.68 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 298 aa  54.3  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2970  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.642297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2667  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.182644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2644  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.773011  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2934  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  36.99 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1332  transcriptional regulator BetI  24.46 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2781  regulatory protein TetR  44.62 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.83276  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2963  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1185  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.273145  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3543  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0364286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 216 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 192 aa  51.6  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  28.37 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  35.82 
 
 		 224 aa  51.6  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 180 aa  51.6  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  31.87 
 
 		 196 aa  51.2  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 228 aa  51.2  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>