More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1320 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  395  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 		 178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 178 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  44.51 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
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NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 179 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  39.2 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 178 aa  132  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  45.22 
 
 		 175 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 181 aa  98.2  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 178 aa  97.4  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  42.14 
 
 		 183 aa  93.6  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 183 aa  90.5  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
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NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 227 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
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NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 227 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 193 aa  85.9  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 186 aa  85.5  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 187 aa  85.1  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
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NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  37.09 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  41.5 
 
 		 168 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
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NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
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NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
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NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 415 aa  74.7  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
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NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 428 aa  72.8  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  32.4 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_2025  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232401  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 186 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
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NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
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NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  36.88 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
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NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
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NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4428  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89429  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
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NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
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NC_013947  Snas_4974  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603654 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2479  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2389  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979129  normal  0.861655 
 
 
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NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 181 aa  61.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  33.77 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  32.26 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  28.41 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 141 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 183 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  40.96 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
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NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
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NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_0985  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 193 aa  51.2  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
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NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  43.9 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
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NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013530  Xcel_2079  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.674297  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
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