More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0622 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 181 aa  367  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 178 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 184 aa  101  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 183 aa  89  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 199 aa  85.5  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 203 aa  84.3  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 208 aa  84.3  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  26.97 
 
 		 187 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 191 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4974  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603654 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4428  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89429  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 190 aa  67.4  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 415 aa  64.7  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 168 aa  62  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  29.48 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5452  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  29.14 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 428 aa  61.2  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 357 aa  60.8  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3347  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.084846  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  25.19 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  27.96 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 190 aa  52  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 307 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  27.49 
 
 		 214 aa  52  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 206 aa  52  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 217 aa  51.6  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>