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for query gene Strop_2360 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 190 aa  378  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  48.95 
 
 		 212 aa  173  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 181 aa  157  9e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 182 aa  136  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4974  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 186 aa  104  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603654 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3347  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.084846  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 244 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2192  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
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NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  40.85 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  40.85 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  29.55 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  30.64 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
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NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  37.97 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
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NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31090  transcriptional regulator, tetR family  37.74 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.565118  n/a   
 
 
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NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 177 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  52.94 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 181 aa  51.6  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3493  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 222 aa  51.6  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 428 aa  51.2  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 193 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 415 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1081  HTH-type transcriptional regulator RutR  38.55 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1231  HTH-type transcriptional regulator RutR  38.55 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1186  HTH-type transcriptional regulator RutR  38.55 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1216  HTH-type transcriptional regulator RutR  37.35 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.591915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  38.46 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1158  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3453  transcriptional regulator TetR family  34.12 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 269 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  45.45 
 
 		 233 aa  48.9  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  48.15 
 
 		 216 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 208 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
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NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  40.35 
 
 		 186 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 245 aa  48.5  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  32.94 
 
 		 211 aa  48.1  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 225 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 234 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
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