More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0730 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  387  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  78.49 
 
 		 190 aa  312  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  40.31 
 
 		 187 aa  141  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  40.31 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4428  transcriptional regulator, TetR family  45.5 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89429  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 357 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 179 aa  97.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 236 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 227 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 141 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 191 aa  88.2  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 201 aa  87.8  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  87.8  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 178 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2025  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 196 aa  74.3  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 183 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3347  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.084846  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4974  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603654 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  23.47 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2192  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  25.6 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  24.57 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 177 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 183 aa  51.6  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3073  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 198 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 198 aa  51.6  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 191 aa  51.2  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 221 aa  51.2  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 209 aa  51.2  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2479  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0994  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.885114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  27.19 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  27.21 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 428 aa  48.9  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  44.23 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  44.23 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2557  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 232 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 181 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  23.42 
 
 		 415 aa  48.1  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 227 aa  48.1  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 208 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 185 aa  47.8  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_3394  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 220 aa  47  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222962 
 
 
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NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2016  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
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NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
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