More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_1394 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
185 aa  383  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  65.19 
 
 
194 aa  249  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  63.54 
 
 
194 aa  248  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  63.54 
 
 
194 aa  247  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  63.54 
 
 
194 aa  247  7e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  62.98 
 
 
194 aa  245  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
197 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 
237 aa  57.4  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  25.84 
 
 
203 aa  57.4  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
179 aa  55.8  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
206 aa  55.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
197 aa  54.7  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
208 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
215 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5271  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 
212 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.869889  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
238 aa  53.9  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 
204 aa  53.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3395  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.584176  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4889  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 
246 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  25.58 
 
 
199 aa  53.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  25.36 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
215 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
205 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
257 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  33.85 
 
 
210 aa  52  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
205 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2301  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 
197 aa  52  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.27 
 
 
207 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
202 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 
194 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
202 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 
201 aa  52  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
202 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
237 aa  51.6  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
198 aa  51.6  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0121  regulatory protein, TetR  43.55 
 
 
209 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.602969 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 
213 aa  51.6  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
191 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2536  putative transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 
215 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 
186 aa  51.2  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 
184 aa  51.2  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
232 aa  51.2  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 
215 aa  51.2  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 
184 aa  51.2  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 
188 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 
219 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
202 aa  50.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 
223 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  29.03 
 
 
219 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 
195 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
257 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 
250 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2446  regulator AmrR  36.76 
 
 
209 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584689  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 
175 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6854  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
224 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.101929  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 
249 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
212 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 
250 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
205 aa  49.7  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 
197 aa  49.7  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
245 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 
194 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
222 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3979  nucleoid occlusion protein  26.36 
 
 
216 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56213  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  35.38 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3574  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 
210 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
200 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  35.38 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 
200 aa  50.1  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 
268 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  43.64 
 
 
193 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0777  nucleoid occlusion protein  26.52 
 
 
217 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  24.8 
 
 
200 aa  49.3  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
212 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  41.54 
 
 
174 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 
202 aa  49.7  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
195 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
192 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 
206 aa  49.3  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
212 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  37.35 
 
 
201 aa  49.3  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
210 aa  49.3  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>