More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2120 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  386  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2823  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335296  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  43.71 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 221 aa  62  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2536  putative transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  52.63 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  32.32 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  29.05 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 324 aa  55.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  28.14 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1468  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 260 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0611  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 248 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 219 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  54 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  57.78 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  54.55 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  28.57 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  59.18 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  47.83 
 
 		 182 aa  52.4  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0212  transcription regulator TetR/AcrR family protein  28.4 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  53.06 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 248 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 202 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 248 aa  52  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 200 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 228 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0180  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0296493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0183  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 234 aa  51.6  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 238 aa  51.6  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  44.44 
 
 		 251 aa  51.2  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  31.09 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 248 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  31.09 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 202 aa  51.2  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 248 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 232 aa  51.2  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 215 aa  51.2  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  31.09 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 202 aa  51.2  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  31.09 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  31.09 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  31.09 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  51.2  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5533  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374337  normal  0.0421471 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  52.27 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>