More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2794 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 184 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  42.26 
 
 		 178 aa  142  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  40.49 
 
 		 168 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 179 aa  111  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 181 aa  101  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  36.91 
 
 		 175 aa  94.7  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 183 aa  94.4  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 184 aa  88.6  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 178 aa  88.2  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  30.41 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 172 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4974  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603654 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  27.74 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 236 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 195 aa  62  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 201 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 190 aa  60.8  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  26.04 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  28.97 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 415 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  29.23 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 357 aa  52  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2479  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 230 aa  51.6  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 181 aa  51.2  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 185 aa  51.2  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  24.86 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31090  transcriptional regulator, tetR family  42.55 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.565118  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4428  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89429  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 183 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 222 aa  48.5  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 218 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 192 aa  48.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 200 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 194 aa  47.8  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 211 aa  47.8  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 200 aa  47.8  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5452  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  21.71 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  24.36 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>