More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3359 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  55.56 
 
 		 211 aa  178  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  39.84 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 221 aa  62  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  46.67 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 414 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3979  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  37.6 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  46.43 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  46.43 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 429 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  38.38 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 178 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 228 aa  52  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 240 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 190 aa  51.6  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 206 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 228 aa  51.2  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1141  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 218 aa  51.2  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  hitchhiker  0.000033846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0829  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1074  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  43.86 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1252  regulatory protein, TetR  29.14 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.409819  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  30.12 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 181 aa  49.3  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 239 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 221 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 235 aa  48.5  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  38.81 
 
 		 231 aa  48.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  57.45 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 221 aa  48.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 205 aa  48.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 194 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 194 aa  48.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 240 aa  48.1  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0925  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 207 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 268 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  33.33 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>