More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1114 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 186 aa  367  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  44.67 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  37.85 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 190 aa  96.3  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 180 aa  94.7  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  37.99 
 
 		 179 aa  92  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 181 aa  88.2  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 178 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37450  transcriptional regulator  40.32 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0726232  normal  0.587989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 175 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  47.22 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 234 aa  62  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 357 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0194  nucleoid occlusion protein  46.77 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  25.64 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 428 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  37.8 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 236 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 		 197 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 255 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4004  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 201 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  31.9 
 
 		 280 aa  52  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 223 aa  51.6  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  33.33 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  33.33 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  33.33 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  33.33 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  33.33 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  33.33 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  35.16 
 
 		 216 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2128  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 201 aa  51.2  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.544484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001824  transcriptional regulator  45.16 
 
 		 196 aa  51.2  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000410739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  31.63 
 
 		 186 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 190 aa  51.2  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 238 aa  51.2  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  32.12 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 244 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 199 aa  50.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4830  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 226 aa  50.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  31.63 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  34.12 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>