229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1672 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 184 aa  367  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  55.87 
 
 		 188 aa  195  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  48.39 
 
 		 186 aa  148  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  49.43 
 
 		 189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  46.41 
 
 		 186 aa  134  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  45.2 
 
 		 186 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  48.75 
 
 		 166 aa  120  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4528  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 172 aa  95.9  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  32.12 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 181 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.17 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  44.55 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  29.17 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  44.33 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 186 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 240 aa  72  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 428 aa  72  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 202 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  31.91 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  38.89 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 248 aa  68.2  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  33.16 
 
 		 197 aa  67  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 237 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 225 aa  67  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3979  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 208 aa  60.8  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3625  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.679664  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0140  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2006  regulatory protein TetR  32.28 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  32.64 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 240 aa  53.9  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1283  regulatory protein TetR  31.78 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07310  hypothetical protein  45 
 
 		 247 aa  52.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608576  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 414 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 198 aa  51.6  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 187 aa  51.6  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
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NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
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NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 245 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_2098  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0785695  n/a   
 
 
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