More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19020 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  389  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  62.86 
 
 		 187 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  55.17 
 
 		 181 aa  177  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3979  transcriptional regulator, TetR family  58.79 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 181 aa  165  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 178 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  43.02 
 
 		 178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  43.02 
 
 		 178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  43.02 
 
 		 178 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  43.02 
 
 		 178 aa  152  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  43.02 
 
 		 178 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 178 aa  152  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  49.13 
 
 		 240 aa  151  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  44.74 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  52.44 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 206 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 206 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  43.31 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2089  transcriptional regulator, TetR family  42.01 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.850407  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  40.83 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22570  hypothetical protein  40.74 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487793  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  35.76 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
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NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 221 aa  71.2  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_4528  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  31.21 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
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NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
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NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
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NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 428 aa  58.9  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
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NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  31.68 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  32.12 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0140  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  32.12 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 429 aa  55.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  31.21 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2010  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.267977  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  43.55 
 
 		 237 aa  53.9  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 241 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  46.55 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 166 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  28.83 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  45.33 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  41.54 
 
 		 237 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 220 aa  52  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 235 aa  52  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 415 aa  52  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 235 aa  52  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 245 aa  52  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 414 aa  51.6  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
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