231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6891 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  381  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38050  hypothetical protein  64.77 
 
 		 214 aa  181  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 203 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 202 aa  153  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  50.81 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  42.78 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3625  putative transcriptional regulator, TetR family  42.61 
 
 		 203 aa  114  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.679664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 181 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  31.96 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07310  hypothetical protein  60.71 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608576  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  32.11 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 428 aa  62.4  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  56 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  58 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  58 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  47.62 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  56 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  31.41 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2006  regulatory protein TetR  58.49 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  22.65 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  22.65 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  23.5 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  23.5 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  23.5 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  31.58 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0140  transcriptional regulator, TetR family  58 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 248 aa  52.8  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 429 aa  52.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 166 aa  51.2  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 181 aa  51.2  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0650  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 414 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  22.53 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  40 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  21.55 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  22.1 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1574  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 435 aa  47.8  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  40 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 273 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 273 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 273 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 276 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>