219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0908 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
178 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  98.88 
 
 
178 aa  366  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  98.88 
 
 
178 aa  366  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  99.44 
 
 
178 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  99.44 
 
 
178 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  99.44 
 
 
178 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  98.88 
 
 
178 aa  366  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  99.44 
 
 
178 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  98.31 
 
 
178 aa  364  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  78.09 
 
 
186 aa  297  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  78.09 
 
 
206 aa  296  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  78.09 
 
 
206 aa  296  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  78.09 
 
 
206 aa  296  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  78.09 
 
 
206 aa  296  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  70.62 
 
 
182 aa  263  8e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 
181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  43.02 
 
 
197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
240 aa  140  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 
187 aa  139  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 
181 aa  131  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 
187 aa  130  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3979  transcriptional regulator, TetR family  39.16 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2089  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 
184 aa  117  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.850407  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 
184 aa  117  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 
204 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22570  hypothetical protein  33.12 
 
 
193 aa  96.3  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487793  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  31.49 
 
 
189 aa  87.8  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  30.29 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  28.41 
 
 
202 aa  71.2  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  29.78 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0140  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 
192 aa  62.4  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 
188 aa  62  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
234 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
221 aa  61.2  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
237 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 
241 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  43.84 
 
 
237 aa  60.5  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
237 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 
221 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  22.65 
 
 
196 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  31.78 
 
 
237 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 
225 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
199 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 
415 aa  58.9  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 
203 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 
241 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
248 aa  57.8  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
234 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
238 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
234 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
234 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
220 aa  57.4  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  28.46 
 
 
197 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 
208 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
218 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
202 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
225 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
203 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
203 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
203 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
225 aa  54.3  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  26.62 
 
 
207 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 
192 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
240 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
187 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 
211 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6235  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 
230 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.706195 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 
428 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
230 aa  52.4  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38050  hypothetical protein  27.12 
 
 
214 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4528  transcriptional regulator, TetR family  24.52 
 
 
172 aa  52  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
221 aa  52  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
209 aa  51.6  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
214 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3158  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2470  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 
410 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2892  regulatory protein, TetR  27.47 
 
 
635 aa  48.5  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794047  normal  0.565465 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 
207 aa  48.1  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6862  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
224 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000147849  normal  0.19991 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
208 aa  48.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.775643 
 
 
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NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
202 aa  47.8  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 
205 aa  47.8  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 
196 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
214 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  39.66 
 
 
215 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
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NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
215 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal 
 
 
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NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 
200 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
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NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal 
 
 
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NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
214 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal 
 
 
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