140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7555 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 414 aa  834    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 429 aa  255  9e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1574  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 435 aa  202  9e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  31.93 
 
 		 189 aa  63.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  34.11 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 203 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 203 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 203 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07310  hypothetical protein  43.04 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608576  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 181 aa  57  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 181 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 192 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  29.68 
 
 		 186 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 194 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 193 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 186 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 224 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 184 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 191 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 185 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  33.07 
 
 		 197 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 245 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 225 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 190 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 182 aa  50.4  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  45.61 
 
 		 213 aa  50.4  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 218 aa  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 197 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 208 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 204 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 207 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 242 aa  48.9  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 206 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 186 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 206 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 206 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 206 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 211 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 196 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 230 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 233 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 240 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 244 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 204 aa  47.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 207 aa  47.8  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 215 aa  47.8  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 203 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 178 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  23.95 
 
 		 192 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  23.95 
 
 		 192 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 205 aa  47.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 221 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  23.95 
 
 		 196 aa  47  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  23.95 
 
 		 196 aa  47  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  23.95 
 
 		 196 aa  47  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  34.78 
 
 		 203 aa  47  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 196 aa  47  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 232 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  23.95 
 
 		 196 aa  47  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  23.95 
 
 		 195 aa  47  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  24.11 
 
 		 184 aa  47  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 199 aa  47  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  23.95 
 
 		 196 aa  47  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 228 aa  46.6  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 196 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 248 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 188 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 178 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 223 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 204 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 225 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 275 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6235  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 230 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.706195 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 275 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 220 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  27.82 
 
 		 198 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 178 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 210 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 178 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 178 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 178 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 203 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  23.08 
 
 		 178 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 178 aa  45.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 204 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 222 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 222 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 222 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  45.61 
 
 		 197 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  37.5 
 
 		 207 aa  44.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 231 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 218 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  23.08 
 
 		 178 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>