119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1138 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 248 aa  504  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  37.96 
 
 		 237 aa  142  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 234 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  35.14 
 
 		 237 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 234 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 234 aa  121  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  33.48 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  32.3 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 218 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 225 aa  99.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 230 aa  89.7  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 184 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  39.19 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 166 aa  62  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  30.34 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.89 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 182 aa  58.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  38.89 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  38.67 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  28.43 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 429 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 186 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 196 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 186 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 225 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 181 aa  50.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 187 aa  48.9  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 209 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07310  hypothetical protein  39.34 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608576  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3979  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 415 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  26.47 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 196 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3625  putative transcriptional regulator, TetR family  51.43 
 
 		 203 aa  46.2  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.679664  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22570  hypothetical protein  36.21 
 
 		 193 aa  46.2  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487793  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 414 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 428 aa  45.8  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2060  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 191 aa  45.4  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38050  hypothetical protein  50 
 
 		 214 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1496  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  35.06 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 197 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 198 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  36.36 
 
 		 197 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 192 aa  43.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>