277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1496 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1496  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2182  transcriptional regulator BetI  56.54 
 
 		 194 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0854  transcriptional regulator BetI  56.54 
 
 		 194 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1898  transcriptional regulator BetI  58.2 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  54.69 
 
 		 194 aa  189  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2312  transcriptional regulator BetI  56.02 
 
 		 194 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.48058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  54.17 
 
 		 201 aa  186  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  53.65 
 
 		 198 aa  184  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3158  TetR family transcriptional regulator  52.15 
 
 		 202 aa  179  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  49.48 
 
 		 202 aa  175  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  47.59 
 
 		 211 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  49.45 
 
 		 208 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1151  transcriptional regulator TetR family  50.6 
 
 		 182 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 195 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  37.63 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  36.98 
 
 		 199 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  37.37 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  36.13 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  36.13 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  36.13 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  34.74 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  36.32 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  36.32 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  36.32 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1198  transcriptional regulator BetI  34.69 
 
 		 201 aa  101  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  35.83 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  36.84 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  34.91 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  37.5 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1121  transcriptional regulator BetI  33.68 
 
 		 201 aa  99.8  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  34.74 
 
 		 196 aa  99  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  36.46 
 
 		 195 aa  98.6  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1009  transcriptional regulator BetI  33.67 
 
 		 201 aa  97.8  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  35.98 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  35.98 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  35.98 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  35.98 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1948  transcriptional regulator BetI  34.1 
 
 		 198 aa  96.3  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200723  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  35.98 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  35.98 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  35.98 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  34.87 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  36.42 
 
 		 197 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 201 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 201 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 201 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4935  transcriptional regulator BetI  34.88 
 
 		 218 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  32.75 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5113  transcriptional regulator BetI  34.88 
 
 		 218 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0491395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  33.69 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 195 aa  90.9  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  35.75 
 
 		 195 aa  90.9  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  35.75 
 
 		 195 aa  90.9  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  35.75 
 
 		 195 aa  90.9  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  34.87 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  35.75 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0440  regulatory protein BetI  33.72 
 
 		 197 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  33.85 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4734  transcriptional regulator BetI  33.92 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  35.2 
 
 		 195 aa  89  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  35.75 
 
 		 195 aa  88.6  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 677 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  35.75 
 
 		 195 aa  88.6  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 195 aa  87.8  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2070  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0713  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0124161  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  30.27 
 
 		 186 aa  87  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6159  transcriptional regulator BetI  34.21 
 
 		 197 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70970  transcriptional regulator BetI  34.21 
 
 		 197 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.790986 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1332  transcriptional regulator BetI  32.12 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 212 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4012  transcriptional regulator BetI  32.37 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2915  transcriptional regulator BetI  33.14 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  28.48 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2925  regulatory protein TetR  38.16 
 
 		 224 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8733  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153176  normal  0.242309 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 244 aa  49.3  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>