More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2925 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2925  regulatory protein TetR  100 
 
 		 224 aa  450  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  50.71 
 
 		 212 aa  205  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  51.63 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  44.55 
 
 		 225 aa  169  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  34.39 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3340  transcriptional regulator, TetR family  21.99 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5040  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5585  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5433  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.944120000000001e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3449  transcriptional regulator, TetR family  21.43 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0291  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 205 aa  72  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  56.92 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1470  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  28.72 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  26.88 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  45.45 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  23.39 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  34.62 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 391 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1920  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2241  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7288  hitchhiker  0.000000000000408452 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  39.06 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  46.15 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4449  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 201 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  38.55 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3697  regulatory protein, TetR  28.68 
 
 		 203 aa  52  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>