More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4449 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4449  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  474  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  62.56 
 
 		 239 aa  271  8.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1920  TetR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  26.4 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2925  regulatory protein TetR  24.58 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  27.4 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  27.4 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  21.55 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  30.36 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  20.99 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5433  transcriptional regulator, TetR family  20.99 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.944120000000001e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  20.99 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5040  TetR family transcriptional regulator  20.99 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  20.99 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  20.99 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  20.99 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  20.99 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  20.99 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  31.76 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3340  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3449  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 497 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  27.42 
 
 		 200 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5585  TetR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  31.51 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  27.4 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0291  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 307 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  39.73 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 195 aa  52.8  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  52.27 
 
 		 201 aa  52.4  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 187 aa  52.4  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 205 aa  52.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 201 aa  52  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 205 aa  52  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  27.61 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  33.11 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3959  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00461459  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  28.22 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2512  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290305  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 224 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 204 aa  49.7  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  23.67 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 222 aa  49.3  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 287 aa  49.3  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 242 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 199 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 286 aa  48.9  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 206 aa  48.9  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  32.91 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>