More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2189 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  462  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 209 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  42.71 
 
 		 209 aa  174  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 209 aa  174  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5433  transcriptional regulator, TetR family  42.71 
 
 		 209 aa  174  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.944120000000001e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 209 aa  174  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5040  TetR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 209 aa  174  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  42.71 
 
 		 209 aa  174  9e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  42.21 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5585  TetR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3340  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3449  transcriptional regulator, TetR family  40.69 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 212 aa  92  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2925  regulatory protein TetR  26.06 
 
 		 224 aa  85.9  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  29.08 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  26.04 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0291  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  21.13 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1920  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  38.54 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 239 aa  62  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36720  transcriptional regulator  30.36 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.72942 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  31.97 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0304  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.826155  hitchhiker  0.000375508 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0324  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  41.18 
 
 		 258 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0854  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.51 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3423  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0914  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.51 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 228 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0946  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.51 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0882  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.51 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  24.2 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  23.95 
 
 		 204 aa  52  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 197 aa  52  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  32.97 
 
 		 202 aa  52  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 310 aa  52  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 225 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2579  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 199 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0967  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.47 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0013  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  52.27 
 
 		 265 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  38.16 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0006  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 199 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0589242  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3117  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 199 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100627  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1978  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 199 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3781  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3842  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3531  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 199 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>