More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_5024 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_5433  transcriptional regulator, TetR family  99.52 
 
 
209 aa  431  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.944120000000001e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  99.04 
 
 
209 aa  430  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  99.52 
 
 
209 aa  431  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
209 aa  432  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5040  TetR family transcriptional regulator  99.52 
 
 
209 aa  431  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  99.04 
 
 
209 aa  431  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  99.52 
 
 
209 aa  430  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  99.04 
 
 
209 aa  427  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  98.56 
 
 
209 aa  425  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  95.69 
 
 
209 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5585  TetR family transcriptional regulator  99 
 
 
200 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3340  transcriptional regulator, TetR family  67.49 
 
 
210 aa  290  8e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3449  transcriptional regulator, TetR family  63.55 
 
 
210 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
222 aa  174  7e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  27.75 
 
 
278 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0291  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
205 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  26.09 
 
 
225 aa  84  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2925  regulatory protein TetR  22.65 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  20.86 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 
205 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 
205 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 
224 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  20.43 
 
 
188 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  22.34 
 
 
196 aa  62.4  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 
200 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
205 aa  62.4  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  23.08 
 
 
197 aa  61.6  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 
200 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 
222 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  24.39 
 
 
210 aa  60.1  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  22.04 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
223 aa  59.3  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
211 aa  58.9  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1920  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
213 aa  58.9  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
203 aa  58.2  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 
200 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  25.19 
 
 
202 aa  58.2  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
239 aa  57.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  24.08 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
217 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
217 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  21.93 
 
 
202 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
217 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
217 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
201 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.17 
 
 
196 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 
217 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 
213 aa  55.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
206 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
217 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
217 aa  55.5  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
202 aa  55.5  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 
219 aa  55.5  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
217 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 
216 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
206 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.82 
 
 
207 aa  55.1  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 
195 aa  55.1  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 
217 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  22.92 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  26.12 
 
 
246 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 
201 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 
189 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  24.83 
 
 
190 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 
217 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4449  TetR family transcriptional regulator  20.13 
 
 
237 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  19.35 
 
 
198 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 
222 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  22.63 
 
 
239 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
222 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  20.43 
 
 
198 aa  53.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
202 aa  52.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
218 aa  52.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  23.26 
 
 
224 aa  52.8  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 
229 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
223 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
770 aa  52.4  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 
203 aa  52.4  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
211 aa  52.4  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  23.74 
 
 
194 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  21.16 
 
 
224 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>